Identifiez vos spectres MS/MS avec scores classiques et ML dans un seul espace.
MSMS Analyzer réunit cosinus, cosinus modifié et modèles à embeddings neuronaux (Spec2Vec, MS-BERT, DreaMS) sur vos bibliothèques de référence — avec des mirror plots interactifs qui rendent chaque correspondance auditable.
Pas de mur d'inscription, aucun paiement. Nous intégrons un petit nombre de laboratoires, à la main.
Fondé sur des briques ouvertes et évaluées par les pairs
MGF · MSP · mzML · JSON
classiques + ML
GNPS · MassBank · MoNA · MS-DIAL · LIPID MAPS
Le problème
L'identification spectrale est éclatée entre des outils qui ne se parlent pas.
Les équipes de métabolomique jonglent : un script pour le cosinus, un autre pour les modèles à embeddings, un visualiseur pour les mirror plots, et encore un importateur par bibliothèque. Comparer les méthodes sur un même spectre — et faire confiance au résultat — prend beaucoup trop de temps.
- Scores classiques et modèles ML vivent dans des pipelines séparés, difficiles à reproduire.
- Les mirror plots sont générés au cas par cas : les correspondances sont dures à auditer et à partager.
- Chaque bibliothèque de référence impose son format et ses subtilités d'import.
Ce que l'outil fait aujourd'hui
Un seul espace, du spectre brut à la correspondance auditable.
Le cœur métabolomique est implémenté et testé. Nous décrivons ci-dessous ce qui fonctionne aujourd'hui — pas une liste de souhaits.
Ingestion multi-formats
Importez MGF, MSP, mzML ou JSON. Les pics sont parsés, normalisés et prêts à scorer en quelques secondes.
Classiques + ML côte à côte
CosineGreedy, ModifiedCosine et scores de pertes neutres à côté des embeddings Spec2Vec, MS-BERT et DreaMS — sur le même spectre.
Mirror plots interactifs
Chaque candidat s'affiche en mirror plot : zoom, inspection pic par pic, partage — pour des identifications auditables, pas une boîte noire.
Recherche en bibliothèques
Importez et interrogez GNPS, MassBank, MoNA, MS-DIAL et LIPID MAPS, regroupés par molécule (InChIKey) pour un tri rapide.
Recherche d'analogues & empreintes
La recherche par similarité vectorielle sur les embeddings fait remonter des analogues structuraux même sans correspondance exacte en bibliothèque.
Copilote d'interprétation
Un assistant optionnel aide à lire les résultats en contexte — en résumant pourquoi un candidat obtient tel score.
Fonctionnement
Quatre étapes, de l'import à l'identification.
- 01
Importer
Déposez vos spectres MS/MS dans n'importe quel format supporté.
- 02
Choisir les méthodes
Sélectionnez les scores classiques et modèles ML à comparer.
- 03
Faire correspondre
Le moteur score contre vos bibliothèques et regroupe les hits par molécule.
- 04
Auditer
Lisez chaque correspondance en mirror plot interactif et exportez ce que vous gardez.
Pour qui
Pensé pour celles et ceux qui font l'identification.
Labos de métabolomique
Identification de petites molécules contre des bibliothèques spectrales — le cœur mature de la plateforme.
Équipes de protéomique
Workflows peptides/protéines DIA — en cours, et taillés pour des partenaires disposant de données DIA.
Sur la feuille de route — construite avec les partenaires
Là où les labos partenaires nous guident ensuite.
Ces capacités sont en cours. Les partenaires en fixent la priorité et les exigences.
Workflows protéomique DIA
Analyse DIA guidée (alphaDIA aujourd'hui ; DIA-BERT pour les partenaires disposant de leur GPU + poids sous licence).
Batch & reporting
Traitements par lots à plus grand volume et rapports exportables, reproductibles, pour environnements régulés.
Votre besoin ici
Tout l'intérêt du programme : les besoins des premiers partenaires fixent la feuille de route proche.
Le programme partenaires
Nous le construisons avec quelques labos — nous ne le vendons pas encore.
MSMS Analyzer est en développement actif. Plutôt qu'un lancement public, nous intégrons un petit nombre de partenaires qui obtiennent un accès anticipé et, en retour, façonnent la suite.
Aucun paiement n'est encaissé pendant le programme partenaires. Cette page n'est pas un paiement — c'est une prise de contact.
Accès anticipé accompagné
Utilisez la plateforme sur vos propres spectres, guidé et soutenu directement par l'équipe.
Influence sur la roadmap
Vos workflows et vos indispensables fixent nos priorités proches.
Co-développement
Nous construisons à vos côtés, en itérant sur des données et des contraintes réelles.
Conditions de partenaire fondateur
Conditions préférentielles au lancement, décidées ensemble — jamais facturées d'avance.
Candidature partenaire
Parlez-nous de votre laboratoire.
Un formulaire court. Nous lisons chaque envoi et répondons personnellement.
Merci — candidature reçue.
Nous reviendrons vers vous personnellement à l'adresse indiquée. D'ici là, n'hésitez pas à préciser vos données par retour.
FAQ
Des réponses claires.
Le produit est-il terminé ?
Non — et nous ne prétendrons pas le contraire. Le cœur d'identification métabolomique fonctionne et est testé ; une partie de l'outillage commercial et protéomique est encore en développement. Le programme partenaires existe justement pour construire le reste avec de vrais labos.
Qu'implique être partenaire de conception ?
Un accès anticipé et accompagné à la plateforme, quelques échanges sur vos workflows, et vos retours au fil de l'usage sur vos propres spectres. Vous aidez à fixer les priorités ; nous construisons.
Est-ce que ça coûte quelque chose ?
Non. Aucun paiement n'est pris pendant le programme partenaires. Si et quand le produit sera prêt à être vendu, les partenaires fondateurs bénéficieront de conditions préférentielles décidées ensemble — jamais facturées d'avance ici.
Qu'advient-il de mes données ?
Pendant le programme, nous n'utilisons les informations envoyées que pour évaluer et suivre votre candidature. Toute donnée d'analyse partagée en tant que partenaire est traitée selon des conditions convenues directement avec vous.
Quelles méthodes et bibliothèques sont supportées ?
Aujourd'hui : scores classiques (CosineGreedy, ModifiedCosine, pertes neutres) et modèles ML (Spec2Vec, MS-BERT, DreaMS), sur GNPS, MassBank, MoNA, MS-DIAL et LIPID MAPS. La protéomique DIA-BERT requiert un modèle sous licence et un GPU, et n'est proposée qu'aux partenaires équipés pour cela.